Orthocoronavirinae
Orthocoronavirinae | ||||||||
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Coronavirus (schematisch) | ||||||||
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Taxonomische Merkmale | ||||||||
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Wissenschaftlicher Name | ||||||||
Orthocoronavirinae | ||||||||
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Orthocoronavirinae ist eine Virusunterfamilie innerhalb der Familie Coronaviridae, die weitestgehend mit dieser übereinstimmt. Die Viren innerhalb dieser Unterfamilie werden (fach)umgangssprachlich Orthocoronaviren und veraltet und zweideutig auch bloß Coronaviren genannt.
Auch alle Coronaviren, die den Menschen infizieren, gehören zu den Orthocoronaviren. Darunter auch SARS-CoV-2, das Virus, das für die aktuelle COVID-19-Pandemie verantwortlich ist.
Beschreibung[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Bis heute (Stand 2020) entspricht die Beschreibung der Unterfamilie Orthocoronavirinae nahezu vollständig der der übergeordneten Familie Coronaviridae. Das liegt daran, dass die einzige Schwestergruppe – die Unterfamilie der Letoviren (Letovirinae) – nur wenig erforscht ist und nur eine einzige Art – Microhyla letovirus 1 – enthält. Neben strukturellen und statistischen Unterschieden im Virusgenom bei computergestützten Analysen (vgl. Bioinformatik) besteht der wesentlichste Unterschied zwischen den beiden Unterfamilien Orthocoronavirinae und Letovirinae vor allem darin, dass die Letoviren die ersten Coronaviren sind, die Amphibien infizieren.[2][3]
Benennung[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Etymologie[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Der Name der Unterfamilie Orthocoronavirinae setzt sich aus dem Vorsatz „Ortho-“ (griechisch ὀρθός orthós, deutsch ‚recht, richtig, aufrecht‘) und dem früheren Namen dieser Unterfamilie Coronavirinae zusammen. „Orthocoronaviren“ bedeutet soviel wie: „richtige, eigentliche, klassische oder echte Coronaviren“. Das entspricht der zuvor gebrauchten umgangssprachlichen Bezeichnung: „echte Coronaviren“ (englisch true coronaviruses[4]), für die Viren dieser Gruppe, bevor die Gruppe den jetzigen Namen erhielt.
Diese Virengruppe wurde zunächst als Gattung unter dem Namen Coronavirus geführt (bis 2008). Durch den Aufstieg in den Rang einer Unterfamilie wurde die Endung in „-virinae“ geändert.[4] Die Herkunft des Namensbestandteils „corona“ wird genauer im Abschnitt Etymologie im Artikel zur Familie Coronaviridae erläutert.
Die Namenserweiterung „Ortho-“ beendete 2018 gewisse Mehrdeutigkeiten, die innerhalb der Familie Coronaviridae aufgrund dessen bestanden, dass der gleiche Wortstamm „Corona-“ für mehrere ineinanderliegende Gruppen verwendet worden war.[5] Näheres unter Taxonomische Hintergründe.
Verwendete Namen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Aus dem Taxonnamen Orthocoronavirinae ergibt sich systematisch die Sammelbezeichnung (englisch collective name[6]) „Orthocoronaviren“ für Viren dieser Unterfamilie.[7][8] Besonders im Englischen wird diese Art der Sammelbezeichnung auch „Vernakularname“ (englisch vernacular name) genannt.[5]
Die Sammelbezeichnung „Orthocoronaviren“ ist noch verhältnismäßig jung im Vergleich zum seit den 1960er Jahren gebrauchten Namen „Coronaviren“.[9] Obwohl der ältere Name „Coronaviren“ zweideutig sowohl die Viren der ganzen Familie[10] als auch nur der Unterfamilie (früher: Gattung[4]) bezeichnet, ist er weiter auch für nur die Viren der Unterfamilie im Gebrauch.[11][12][13][14][15]
Aus diesen Gründen existieren grundsätzlich immer noch zwei Vernakularnamen für die Viren dieser Gruppe. Einmal der doppeldeutige Name „Coronaviren“ (englisch coronaviruses). Dieser findet sich in Literatur bis 2018[16] und häufig auch noch nach 2018. Und dann der eindeutige Name „Orthocoronaviren“ als taxonomische Sammelbezeichnung seit 2018. Der eigentlich korrekte und eindeutige englische Vernakularname "coronavirids" findet allerdings auch heute noch nur gelegentlich Verwendung,[17] dieser ist analog der Bezeichnung nanovirids des ICTV[18] für die Familie Nanoviridae, sowie hominids bzw. camelids[19] für die Familien der Hominiden respektive Cameliden gebildet.[Anm. 1]
Wegen der Namensähnlichkeit zwischen Familie und Unterfamilie kommt es allenthalben auch zur Falschschreibung des Unterfamiliennamens in der Form: Orthocoronaviridae.[20]
Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Äußere Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Die Unterfamilie Orthocoronavirinae besitzt in der Familie Coronaviridae mit Stand 7. Mai 2024 die beiden Schwester-Unterfamilien Letovirinae und Pitovirinae. Nicht mehr dabei die frühere Schwester-Unterfamilie Torovirinae, die 2018 zur heutigen Familie Tobaniviridae mit der neuen(!) Unterfamilie Torovirinae hochgestuft wurde.[2]
Familie Unterfamilie Coronaviridae Letovirinae Pitovirinae Orthocoronavirinae
Innere Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Systematische Darstellung nach ICTV (Stand: 7. Mai 2024).[21][22]
Unterfamilie Orthocoronavirinae
- Gattung Alphacoronavirus (ehem. Phylogruppe Gruppe-1-Coronaviren[23])
- Untergattung Amalacovirus
- Spezies Alphacoronavirus almalfi (früher Alphacoronavirus AMALF) mit
- Bat alphacoronavirus isolate AMA_L_F (BtCoV-AMA-L-F)
Isolat: AMA_L_F
- Bat alphacoronavirus isolate AMA_L_F (BtCoV-AMA-L-F)
- Spezies Alphacoronavirus almalfi (früher Alphacoronavirus AMALF) mit
- Untergattung Colacovirus
- Spezies Alphacoronavirus myotis mit
- Bat coronavirus CDPHE15 (BtCoV CDPHE15)
Isolat: bat/USA/CDPHE15/2006
- Bat coronavirus CDPHE15 (BtCoV CDPHE15)
- Spezies Alphacoronavirus myotis mit
- Untergattung Decacovirus
- Spezies Alphacoronavirus australiense (früher Alphacoronavirus WA3607, provisorisch Alphacoronavirus sp. WA3607) mit
- Alphacoronavirus WA3607 (ACoV-WA3607)
Isolat: WA3607
- Alphacoronavirus WA3607 (ACoV-WA3607)
- Spezies Alphacoronavirus ferrumequini mit
- Bat Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB2013 [BtRf-AlphaCoV/HuB2013] (BtRf-AlphaCoV)
Isolat: BtRf-HuB2013
- Bat Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB2013 [BtRf-AlphaCoV/HuB2013] (BtRf-AlphaCoV)
- Spezies Alphacoronavirus hipposideri (früher Alphacoronavirus CHB25) mit
- Hipposideros pomona bat coronavirus CHB25 (HipPBCoV-CHB25)
Isolat: CHB0025
- Hipposideros pomona bat coronavirus CHB25 (HipPBCoV-CHB25)
- Spezies Alphacoronavirus rousetti mit
- Rousettus bat coronavirus HKU10 (BtCoV HKU10)
Isolat: 183A
- Rousettus bat coronavirus HKU10 (BtCoV HKU10)
- Spezies Alphacoronavirus australiense (früher Alphacoronavirus WA3607, provisorisch Alphacoronavirus sp. WA3607) mit
- Untergattung Duvinacovirus
- Spezies Alphacoronavirus chicagoense mit
- Humanes Coronavirus 229E, engl. Human coronavirus 229E (HCoV_229E)
Isolate: 229E und J0304
- Humanes Coronavirus 229E, engl. Human coronavirus 229E (HCoV_229E)
- Spezies Alphacoronavirus chicagoense mit
- Untergattung Luchacovirus
- Spezies Alphacoronavirus ratti mit
- Lucheng Rn rat coronavirus (LRNV)
Isolat: Lucheng-19
- Lucheng Rn rat coronavirus (LRNV)
- Spezies Alphacoronavirus ratti mit
- Untergattung Minacovirus
- Spezies Alphacoronavirus neovisontis mit
- Mink coronavirus [Mink coronavirus 1] (MCoV, MCoV-1)
Isolat: WD1127 - Ferret coronavirus
- Mink coronavirus [Mink coronavirus 1] (MCoV, MCoV-1)
- Spezies Alphacoronavirus neovisontis mit
- Untergattung Minunacovirus
- Spezies Alphacoronavirus miniopteri mit
- Miniopterus bat coronavirus HKU8 (Mi-BatCoV_HKU8, Bat-CoV-HKU8)
Isolat: AFCD77
- Miniopterus bat coronavirus HKU8 (Mi-BatCoV_HKU8, Bat-CoV-HKU8)
- Spezies Alphacoronavirus pusilli mit
- Miniopterus bat coronavirus 1 (Mi-BatCoV_1A)
Isolat: AFCD62
- Miniopterus bat coronavirus 1 (Mi-BatCoV_1A)
- Spezies Alphacoronavirus miniopteri mit
- Untergattung Myotacovirus
- Spezies Alphacoronavirus ricketti mit
- Bat Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011 [BtMr-AlphaCoV/SAX2011] (BtMr-AlphaCoV)
Isolat: BtMr-SAX2011
- Bat Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011 [BtMr-AlphaCoV/SAX2011] (BtMr-AlphaCoV)
- Spezies Alphacoronavirus ricketti mit
- Untergattung Nyctacovirus
- Spezies Alphacoronavirus chalinolobi (provisorisch Alphacoronavirus sp. WA2028) mit
- Alphacoronavirus WA2028 (ACoV-WA2028)
Isolat: WA2028
- Alphacoronavirus WA2028 (ACoV-WA2028)
- Spezies Alphacoronavirus nyctali mit
- Bat Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013 [BtNv-AlphaCoV/SC2013] (BtNv-AlphaCoV)
Isolat: BtNv-SC2013
- Bat Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013 [BtNv-AlphaCoV/SC2013] (BtNv-AlphaCoV)
- Spezies Alphacoronavirus pipistrelli mit
- Bat Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398 [Alphacoronavirus Bat-CoV/P.kuhlii/Italy/3398-19/2015] (PK-BatCoV)
Isolat: P.kuhlii/Italy/3398/2015
- Bat Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398 [Alphacoronavirus Bat-CoV/P.kuhlii/Italy/3398-19/2015] (PK-BatCoV)
- Spezies Alphacoronavirus tylonycteridis mit
- Tylonycteris bat coronavirus HKU33 (TyBCoV-HKU33)
Isolat: GZ151867
- Tylonycteris bat coronavirus HKU33 (TyBCoV-HKU33)
- Spezies Alphacoronavirus chalinolobi (provisorisch Alphacoronavirus sp. WA2028) mit
- Untergattung Pedacovirus
- Spezies Alphacoronavirus finnoniense mit
- Bat Myotis daubentonii Alphacoronavirus 020_16 [Bat alphacoronavirus BtCoV/020_16/M.dau/FIN/2016] (BtCoV/020_16/M.dau/FIN/2016)
Isolat: 020_16
- Bat Myotis daubentonii Alphacoronavirus 020_16 [Bat alphacoronavirus BtCoV/020_16/M.dau/FIN/2016] (BtCoV/020_16/M.dau/FIN/2016)
- Spezies Alphacoronavirus gouldii (provisorisch Alphacoronavirus sp. WA1087) mit
- Alphacoronavirus WA1087 (ACoV-WA1087)
Isolat: WA1087
- Alphacoronavirus WA1087 (ACoV-WA1087)
- Spezies Alphacoronavirus porci mit
- Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Isolat: CV777
- Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
- Spezies Alphacoronavirus scotophili mit
- Scotophilus bat coronavirus 512 (Sc-BatCoV_512)
Isolat: 512/2005
- Scotophilus bat coronavirus 512 (Sc-BatCoV_512)
- Spezies Alphacoronavirus finnoniense mit
- Untergattung Rhinacovirus
- Spezies Alphacoronavirus rhinolophi mit
- Rhinolophus bat coronavirus HKU2 (Rh-BatCoV_HKU2, Bat-CoV-HKU2)
Isolat: GD/430/2006 - Enterisches Schweine-Alphacoronavirus, engl. Swine enteric alphacoronavirus [Swine acute diarrhea syndrome coronavirus] (SeACoV, SADS-CoV)[24][25][26]
Rekombinante: rSADS-CoV, z. B. rSADS-CoV-tRFP mit tRFP (tomato red fluorescent protein)[26]
- Rhinolophus bat coronavirus HKU2 (Rh-BatCoV_HKU2, Bat-CoV-HKU2)
- Spezies Alphacoronavirus rhinolophi mit
- Untergattung Setracovirus
- Spezies Alphacoronavirus amsterdamense mit
- Humanes Coronavirus NL63, engl. Human coronavirus NL63 (HCoV_NL63) – kommt auch in Fledermäusen vor[27]
Isolat: Amsterdam I
- Humanes Coronavirus NL63, engl. Human coronavirus NL63 (HCoV_NL63) – kommt auch in Fledermäusen vor[27]
- Spezies Alphacoronavirus triaenopis mit
- Kenya NL63-related bat coronavirus BtKYNL63-9b (BtKYNL63-9b)
Wirt: Triaenops afer (Afrikanische Dreizahnblattnase)
- Kenya NL63-related bat coronavirus BtKYNL63-9b (BtKYNL63-9b)
- Spezies Alphacoronavirus amsterdamense mit
- Untergattung Soracovirus
- Spezies Alphacoronavirus soricis mit
- Sorex araneus coronavirus T14 [Common shrew coronavirus Tibet-2014] (Sa-CoV_T14)
- Spezies Alphacoronavirus soricis mit
- Untergattung Sunacovirus
- Spezies Alphacoronavirus sunci mit
- Suncus murinus coronavirus X74 [Suncus murinus coronavirus Xingguo-74] (Sm-CoV_X74)
- Spezies Alphacoronavirus sunci mit
- Untergattung Tegacovirus
- Spezies Alphacoronavirus suis (früher Alphacoronavirus 1,*) mit
- Transmissible gastroenteritis virus (TGEV) inkl. Porcine respiratory coronavirus
Isolat: PUR46-MAD[28] - Swine enteric coronavirus
- Canines Coronavirus, engl. Canone coronavirus (CCov)
- Felines Coronavirus, engl. Feline coronavirus (FCov)
Isolate: Felines Infektiöses Peritonitis-Virus, engl. Feline infectious peritonitis virus (FIPV/79-1146), Felines Enterales Coronavirus, engl. Feline enteric coronavirus (FECV/79-1683), Felines Coronavirus 23 (FCov-23), Felines Coronavirus RM (FCov-RM), Acinonyx jubatus coronavirus, … - Swine enteric coronavirus
- Transmissible gastroenteritis virus (TGEV) inkl. Porcine respiratory coronavirus
- Spezies Alphacoronavirus suis (früher Alphacoronavirus 1,*) mit
- Untergattung Amalacovirus
- Gattung Betacoronavirus (ehem. Phylogruppe Gruppe-2-Coronaviren[23]
- Untergattung Embecovirus
- Spezies Betacoronavirus gravedinis (früher Betacoronavirus 1) mit
- Humanes Coronavirus OC43, engl. Human coronavirus OC43 (HCoV_OC43)[29] – kommt auch in Nagetieren vor.[27]
Isolat: ATCC VR-759 - Bovines Coronavirus (BCoV)
- Equines Coronavirus (ECoV-NC99)
- Porzines hämagglutinierendes Enzephalomyelitis-Virus (HEV, PHEV)[26][30]
- Humanes Enterisches Coronavirus (HECoV)
- Humanes Coronavirus OC43, engl. Human coronavirus OC43 (HCoV_OC43)[29] – kommt auch in Nagetieren vor.[27]
- Spezies Betacoronavirus hongkongense mit
- Humanes Coronavirus HKU1, angl. Human coronavirus HKU1 (HCoV_HKU1) – kommt auch in Nagetieren vor[27]
Isolat: HKU1
- Humanes Coronavirus HKU1, angl. Human coronavirus HKU1 (HCoV_HKU1) – kommt auch in Nagetieren vor[27]
- Spezies Betacoronavirus muris (früher Murine coronavirus,*) mit
- Murines Hepatitis-Virus, engl. Murine hepatitis virus (MHV)
Isolat: A59 - Ratten-Coronavirus, engl. rat coronavirus (RtCoV)[31]
- Puffinosis coronavirus (PV) – bei Schwarzschnabel-Sturmtauchern (Puffinus puffinus)
- Murines Hepatitis-Virus, engl. Murine hepatitis virus (MHV)
- Spezies Betacoronavirus myodae mit
- Myodes coronavirus 2JL14 [Myodes rufocanus vole coronavirus 2/JL2014] (MrufCoV_2JL14)
Isolat: 2JL14
- Myodes coronavirus 2JL14 [Myodes rufocanus vole coronavirus 2/JL2014] (MrufCoV_2JL14)
- Spezies Betacoronavirus ratti mit
- China Rattus coronavirus HKU24 [Betacoronavirus HKU24] (ChRCoV_HKU24, RtCov-HKU24)
Isolat: HKU24-R05005I
- China Rattus coronavirus HKU24 [Betacoronavirus HKU24] (ChRCoV_HKU24, RtCov-HKU24)
- Spezies Betacoronavirus gravedinis (früher Betacoronavirus 1) mit
- Untergattung Hibecovirus
- Spezies Betacoronavirus hipposideri mit
- Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013 [Bat Hipposideros pratti Betacoronavirus Zhejiang2013, Bat Hp-betacoronavirus/Zhejiang2013] (Bat_Hp-BetaCoV)
Isolat: Zhejiang2013
- Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013 [Bat Hipposideros pratti Betacoronavirus Zhejiang2013, Bat Hp-betacoronavirus/Zhejiang2013] (Bat_Hp-BetaCoV)
- Spezies „Buhirugu virus 1“[32]
- Spezies Betacoronavirus hipposideri mit
- Untergattung Merbecovirus
- Spezies Betacoronavirus cameli mit
- Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Isolat: HCoV-EMC
- Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
- Spezies Betacoronavirus erinacei mit
- Hedgehog coronavirus 1 (EriCoV)
Isolat: 2012-174/GER/2012
- Hedgehog coronavirus 1 (EriCoV)
- Spezies Betacoronavirus pipistrelli mit
- Pipistrellus bat coronavirus HKU5 (Pi-BatCoV_HKU5)
Isolat: LMH03f
- Pipistrellus bat coronavirus HKU5 (Pi-BatCoV_HKU5)
- Spezies Betacoronavirus tylonycteridis mit
- Tylonycteris bat coronavirus HKU4 (Ty-BatCoV-HKU4)
Isolat: B04f
- Tylonycteris bat coronavirus HKU4 (Ty-BatCoV-HKU4)
- Spezies Betacoronavirus cameli mit
- Untergattung Nobecovirus
- Spezies Betacoronavirus cororeum mit
- Rousettus bat coronavirus GCCDC1 (Ro-BatCoV_GCCDC1)
Isolat: GCCDC1 356
- Rousettus bat coronavirus GCCDC1 (Ro-BatCoV_GCCDC1)
- Spezies Betacoronavirus eidoli mit
- Eidolon helvum bat coronavirus CMR704-P12 (Ei-BatCoV_C704)
- Spezies Betacoronavirus rousetti mit
- Rousettus bat coronavirus HKU9 (Ro-BatCoV_HKU9)
Isolat: BF_005I
- Rousettus bat coronavirus HKU9 (Ro-BatCoV_HKU9)
- Spezies Betacoronavirus cororeum mit
- Untergattung Sarbecovirus
- Spezies Betacoronavirus pandemicum (früher SARS-related coronavirus, SARSr-CoV)[33] mit
- Severe acute respiratory syndrome coronavirus [SARS coronavirus] (SARS-CoV, SARS-CoV-1) – Erreger von SARSref name="arambaut2020 a">Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry: The Proximal Origin of SARS-CoV-2. Auf: virologica.org, Quelle: ARTIC Network, 17. Februar 2020.</ref>
Isolate Tor2 und PC4-227 - Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 [SARS coronavirus 2, 2019-novel Coronavirus, Wuhan seafood market pneumonia virus] (SARS-CoV-2, 2019-nCoV) – Erreger von COVID-19[34]ref name="Lam2020-02">Tommy Tsan-Yuk Lam, Marcus Ho-Hin Shum, Hua-Chen Zhu, Yi-Gang Tong, Xue-Bing Ni, Yun-Shi Liao, Wei Wei, William Yiu-Man Cheung, Wen-Juan Li, Lian-Feng Li, Gabriel M. Leung, Edward C. Holmes, Yan-Ling Hu, Yi Guan: Identification of 2019-nCoV related coronaviruses 1 in Malayan pangolins in southern China. auf: bioRxiv vom 18. Februar 2020, doi:10.1101/2020.02.13.945485 (Preprint), doi:10.1038/s41586-020-2169-0 (neuere Version: „Identifying SARS-CoV-2 related coronaviruses in Malayan pangolins“).</ref>
Isolat: Wuhan-Hu-1 - Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus BtKY72 (SARSr-CoV BtKY72)
Isolat: BtKY72
- Severe acute respiratory syndrome coronavirus [SARS coronavirus] (SARS-CoV, SARS-CoV-1) – Erreger von SARSref name="arambaut2020 a">Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry: The Proximal Origin of SARS-CoV-2. Auf: virologica.org, Quelle: ARTIC Network, 17. Februar 2020.</ref>
- Spezies Betacoronavirus pandemicum (früher SARS-related coronavirus, SARSr-CoV)[33] mit
- Untergattung Embecovirus
- Gattung Gammacoronavirus (ehem. Phylogruppe Gruppe-3-Coronaviren[23]
- Untergattung Brangacovirus
- Spezies Gammacoronavirus brantae mit
- Goose coronavirus CB17 [Canada goose-Branta canadensis-coronavirus-Cambridge Bay 2017] (BcanCoV_CB17)
Isolat: CB17
- Goose coronavirus CB17 [Canada goose-Branta canadensis-coronavirus-Cambridge Bay 2017] (BcanCoV_CB17)
- Spezies Gammacoronavirus brantae mit
- Untergattung Cegacovirus
- Spezies Gammacoronavirus delphinapteri mit
- Beluga whale coronavirus SW1 (BWCoV)
Isolat: SW1 - Bottlenose dolphin coronavirus HKU22 (BdCoV_HKU22)
Isolat: CF090325
- Beluga whale coronavirus SW1 (BWCoV)
- Spezies Gammacoronavirus delphinapteri mit
- Untergattung Igacovirus
- Spezies Gammacoronavirus anatis mit
- Duck coronavirus 2714 (DuCoV_2714)
Isolat: DK/GD/27/2014
- Duck coronavirus 2714 (DuCoV_2714)
- Spezies Gammacoronavirus galli (früher Avian coronavirus,*) mit
- Infectious bronchitis virus (IBV)
Isolat: Beaudette
- Infectious bronchitis virus (IBV)
- Spezies Gammacoronavirus pulli mit
- Avian coronavirus 9203 [Infectious bronchitis virus Ind-TN92-03] (ACoV_9203)
- Spezies Gammacoronavirus anatis mit
- Untergattung Brangacovirus
- Gattung Deltacoronavirus
- Untergattung Andecovirus
- Spezies Deltacoronavirus marecae mit
- Wigeon coronavirus HKU20 (WiCoV_HKU20)
Isolat: 9243
- Wigeon coronavirus HKU20 (WiCoV_HKU20)
- Spezies Deltacoronavirus marecae mit
- Untergattung Buldecovirus
- Spezies Deltacoronavirus gallinulae mit
- Common moorhen coronavirus HKU21 (CMCoV_HKU21)
- Spezies Deltacoronavirus lonchurae mit
- Munia coronavirus HKU13 (MunCV_HKU13)
Isolat: 3514
- Munia coronavirus HKU13 (MunCV_HKU13)
- Spezies Deltacoronavirus pycnonoti (*) mit
- Bulbul coronavirus HKU11 (BulCV_HKU11)
Isolat: 934
- Bulbul coronavirus HKU11 (BulCV_HKU11)
- Spezies Deltacoronavirus suis mit
- Porcine coronavirus HKU15 (PoCoV_HKU15)
Isolat: 155
- Porcine coronavirus HKU15 (PoCoV_HKU15)
- Spezies Deltacoronavirus zosteropis mit
- White-eye coronavirus HKU16 (WECoV_HKU16)
Isolat: 6847
- White-eye coronavirus HKU16 (WECoV_HKU16)
- Spezies Deltacoronavirus gallinulae mit
- Untergattung Herdecovirus
- Spezies Deltacoronavirus nycticoracis mit
- Night heron coronavirus HKU19 (NHCoV_HKU19)
Isolat: 6918
- Night heron coronavirus HKU19 (NHCoV_HKU19)
- Spezies Deltacoronavirus nycticoracis mit
- Untergattung Andecovirus
Anm.: Bei den Virusbezeichnungen sind Synonyme und Schreibvarianten in eckige Klammern gesetzt, Akronyme in runde.
Taxonomische Hintergründe[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
Die taxonomische Benennung und Einordnung der Orthocoronaviren fand immer vor dem Hintergrund der taxonomischen Gesamtorganisation der Virenfamilie Coronaviridae statt und kann dort nachgelesen werden.
Anmerkungen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
- ↑ Das ICTV benutzt diese Konstruktion dort zur Unterscheidung von den "nanoviruses", d. h. den Mitgliedern der Gattung Nanovirus innerhalb dieser Familie. Ähnlich findet man "geminivirids" und "genomovirids" für die Geminiviridae respektive Genomoviridae im ICTV-akzeptierten Vorschlag 2019.012DA.v1 (ZIP: docx, xlsx) von Krupovic et al. (2019) zum Phylum Cressdnaviricota.
Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]
- ↑ a b c d e f g h ICTV Master Species List 2019.v1. In: International Committee on Taxonomy of Viruses (Hrsg.): ICTV Files. Revision 2019. EC 51, Berlin Juli 2019, MSL #35 (englisch, Volltext [XLSX; 629 kB; abgerufen am 7. August 2020]).
- ↑ a b J. Ziebuhr, R.S. Baric, S. Baker, R.J. de Groot, C. Drosten, A. Gulyaeva, B.L. Haagmans, B.W. Neuman, S. Perlman, L.L.M. Poon, I. Sola, A.E. Gorbalenya: 2017.012_015S.A.v1.Nidovirales. In: Virus Taxonomy. History. Revision 2018a, Juli. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), 18. Februar 2017, Proposal-Code 2017.012_015S (ictvonline.org [ZIP; 5,1 MB; abgerufen am 7. Mai 2020]).
- ↑ Khulud Bukhari, Geraldine Mulley, Anastasia A. Gulyaeva, Lanying Zhao, Guocheng Shu, Jianping Jiang, Benjamin W. Neuman: Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus. In: Virology. Band 524, Ausgabe November 2018, S. 160–171. Elsevier, 7. September 2018, doi:10.1016/j.virol.2018.08.010, PMID 30199753, PMC 7112036 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 3,3 MB; abgerufen am 18. Mai 2020] „Coronavirinae“: heute „Orthocoronavirinae“.).
- ↑ a b c Raoul J. de Groot, John Ziebuhr, Leo L. Poon, Patrick C.Woo, Pierre Talbot, Peter J.M. Rottier, Kathryn V. Holmes, Ralph Baric, Stanley Perlman, Luis Enjuanes, Alexander E. Gorbalenya: Revision of the family Coronaviridae. Proposal. In: Virus Taxonomy. History. Revision 2009, Juni. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), 2008, Proposal-Code 2008.085-126V (englisch, ictvonline.org [PDF; 175 kB; abgerufen am 5. Mai 2020]).
- ↑ a b H. J. Vetten, A.-L. Haenni: Taxon-specific suffixes for vernacular names. In: Virology Division of the International Union of Microbiological Societies (Hrsg.): Archives of Virology (= International Committee on Taxonomy of Viruses [Hrsg.]: Virology Division News). Band 151, Juni 2006. Springer-Verlag, 23. März 2006, ISSN 0304-8608, S. 1249–1250, doi:10.1007/s00705-006-0743-x, PMID 16721512, PMC 7086949 (freier Volltext) – (englisch).
- ↑ How to write virus and species names? In: ICTV-Homepage. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), 6. April 2020, archiviert vom (nicht mehr online verfügbar) am 9. Juni 2019; abgerufen am 8. August 2020 (englisch). Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
- ↑ Gideon J. Mordecai, Ian Hewson (Verf.); Emily S. Bailey, Alexander Culley (Gutachter): Coronaviruses in the Sea. Mini Review. In: Andrew S. Lang (Hrsg.): Frontiers in Microbiology. Band 11, Ausgabe Juli 2020, Artikelnr. 1795, 24. Juli 2020, S. 2, doi:10.3389/fmicb.2020.01795 (englisch, Vernakularname „Orthocoronavirus“.): “Orthocoronavirus-like sequences”
- ↑ Jamie A. Mawhinney, Catherine Wilcock, Hasan Haboubi, Shahbaz Roshanzamir: Neurotropism of SARS-CoV-2: COVID-19 presenting with an acute manic episode. Case report. In: BMJ Case Reports. Band 13, Nr. 6, Ausgabe Juni 2020, Artikelnr. e236123, 14. Juni 2020, doi:10.1136/bcr-2020-236123, PMID 32540882, PMC 7298665 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 201 kB; abgerufen am 7. August 2020] Vernakularname „Orthocoronavirus“.): “the orthocoronavirus subfamily”
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- ↑ Yosra A. Helmy, Mohamed Fawzy, Ahmed Elaswad, Ahmed Sobieh, Scott P. Kenney, Awad A. Shehata: The COVID-19 Pandemic: A Comprehensive Review of Taxonomy, Genetics, Epidemiology, Diagnosis, Treatment, and Control. Review. In: Journal of Clinical Medicine. Band 9, Nr. 4, Ausgabe April 2020, Artikelnr. 1225. MDPI, 24. April 2020, doi:10.3390/jcm9041225, PMID 32344679, PMC 7230578 (freier Volltext) – (englisch, 29 S., Volltext [PDF; 2,4 MB; abgerufen am 8. August 2020]).
- ↑ Sarah Young: Orthocoronavirinae: What does it mean and which other viruses are in the subfamily? In: The Independent. 18. Juni 2020, abgerufen am 7. August 2020 (englisch, doppeldeutige Wortverwendung, Familie vs. Unterfamilie): „Each of the coronaviruses belong to an overarching sub-family […] called "orthocoronavirinae" […]. The term "orthocoronavirinae" represents a "sub-family" of the [family of the] coronaviruses […].“
- ↑ Hayder M. Al-Kuraishy, Ali I. Al-Gareeb: From SARS-CoV to nCoV-2019: Ruction and Argument. Brief Report. In: Archives of Clinical Infectious Diseases. Band 15 (COVID-19), Ausgabe April 2020, Artikelnr. e102624, 1. April 2020, Abstract und 1. Background, doi:10.5812/archcid.102624 (englisch, Volltext [PDF; 2,6 MB; abgerufen am 7. August 2020] Falsche Zuordnung aller Coronaviren nur zur Unterfamilie.): “Coronaviruses (CoVs) […]. CoVs constitute the subfamily Orthocoronavirinae, in the family Coronaviridae.”
- ↑ Ariane J. Brown, John J. Won, Rachel L. Graham, Kenneth H. Dinnon III., Amy C. Sims, Joy Y. Feng, Tomas Cihlar, Mark R. Denison, Ralph S. Baric, Timothy P. Sheahan: Broad spectrum antiviral remdesivir inhibits human endemic and zoonotic deltacoronaviruses with a highly divergent RNA dependent RNA polymerase. In: Antiviral Research. Band 169, Ausgabe September 2019, Artikelnr. 104541. Elsevier, 21. Juni 2019, ISSN 0166-3542, Abstract, doi:10.1016/j.antiviral.2019.104541, PMID 31233808, PMC 6699884 (freier Volltext) – (englisch, Falsche Bezeichnung von Orthocoronavirinae als Familie, falsche Zuordnung von Abkürzung „CoV“ (gehört zur Familie, nicht Unterfamilie) usw.): “The […] Orthocoronavirinae (CoV) family […].”
- ↑ Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo: Global Epidemiology of Bat Coronaviruses. Review. In: Viruses. Band 11, Nr. 2, Ausgabe Februar 2019, Artikelnr. 174. MDPI, 20. Februar 2019, doi:10.3390/v11020174, PMID 30791586, PMC 6409556 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 2,2 MB; abgerufen am 7. August 2020] Es wird die Unterfamilie beschrieben (= vier Gattungen etc.) und allen Coronaviren zugeordnet.): “Coronaviruses (CoVs) […]. CoVs are classified into four genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus and Deltacoronavirus.”
- ↑ Yi Fan, Kai Zhao, Zheng-Li Shi, Peng Zhou: Bat Coronaviruses in China. Review. In: Viruses. Band 11, Nr. 3, Ausgabe März 2019, Artikelnr. 210. MDPI, 2. März 2019, doi:10.3390/v11030210, PMID 30832341, PMC 6466186 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 1,9 MB; abgerufen am 7. August 2020] Falsche Zuordnung aller Coronaviren zur Unterfamilie.): Coronavirus Taxonomy[. …] Coronaviruses (CoVs) belong to the subfamily Orthocoronavirinae in the family Coronaviridae […].
- ↑ Khulud Bukhari, Geraldine Mulley, Anastasia A. Gulyaeva, Lanying Zhao, Guocheng Shu, Jianping Jiang, Benjamin W. Neuman: Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus. In: Virology. Band 524, Ausgabe November 2018, S. 160–171. Elsevier, 7. September 2018, doi:10.1016/j.virol.2018.08.010, PMID 30199753, PMC 7112036 (freier Volltext) – (englisch, Volltext [PDF; 3,3 MB; abgerufen am 18. Mai 2020] „Korrekte“ doppeldeutige Wortverwendung von „Coronaviren“ vor Existenz von Orthocoronavirinae.): “[…] a sister group to all known coronaviruses, but still within the Coronavirinae.”
- ↑ Ravi Shankar Singh, Abhishek Kumar Singh, Kamla Kant Shukla, Amit Kumar Tripathi: COVID-19 Pandemic: Evidences from Clinical Studies, in: J Comm Pub Health Nursing 6(4):251, 21. September 2020, ISSN 2471-9846
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- ↑ Yosra A. Helmy, Mohamed Fawzy, Ahmed Elaswad, Ahmed Sobieh, Scott P. Kenney, Awad A. Shehata: The COVID-19 Pandemic: A Comprehensive Review of Taxonomy, Genetics, Epidemiology, Diagnosis, Treatment, and Control. Review. In: Journal of Clinical Medicine. Band 9, Nr. 4, Ausgabe April 2020, Artikelnr. 1225. MDPI, 24. April 2020, doi:10.3390/jcm9041225, PMID 32344679, PMC 7230578 (freier Volltext) – (englisch, 29 S., Volltext [PDF; 2,4 MB; abgerufen am 8. August 2020] Falschschreibung mit »d« statt »n«.): “Coronaviridae is classified into two subfamilies, namely, Letovirinae and Orthocoronavirinae. […] Orthocoronaviridae is further classified […] (ICTV 2018).”
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- Affen fressen Fledermauskot: Regenwald-Abholzung könnte neue Seuchen hervorbringen. Auf: n-tv.de vom 29. April 2024.
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- ↑ Chengxin Zhang, Wei Zheng, Xiaoqiang Huang, Eric W. Bell, Xiaogen Zhou, and Yang Zhang: Protein Structure and Sequence Reanalysis of 2019-nCoV Genome Refutes Snakes as Its Intermediate Host and the Unique Similarity between Its Spike Protein Insertions and HIV-1. In: Journal of Proteome Research. Band 19, Nr. 4. American Chemical Society, 22. März 2020, S. 1351–1360, doi:10.1021/acs.jproteome.0c00129 (englisch, Volltext [PDF; 7,1 MB; abgerufen am 6. Juni 2020] Halb kursiv gesetzt: Manis-CoV, scheinbar bzgl. Wirtstier-Typografie: Manis javanica): “2019-nCoV and the Manis coronavirus (Manis-CoV)”